Era profesional Los Miuras
En
se inscribe como
Atlético Junior para participar en el
. Junior termina subcampeón del torneo, terminando cuatro puntos por debajo de
. De este torneo se destacan las victorias 8-3 sobre
y 6-0 sobre Once Deportivo, ambas en
.
Al año siguiente es requerido por la Adefutbol para representar nuevamente a
en el
, terminando último con solo 2 puntos, resultado de dos empates y 5 derrotas. Este hecho le causó problemas con la
, quien le impidió jugar el
. Luego de este hecho, Junior regresó con varias estrellas brasileñas y colombianas para disputar los torneos colombianos de
,
,
y
, destacando entre sus filas el famoso arquero
, sin embargo, los resultados no fueron buenos y teniendo como mejor resultado un sexto puesto en
,
Junior debió retirarse de la
al final de
por problemas económicos, pasando a jugar nuevamente en el torneo aficionado de la Liga de Fútbol del
por 13 años aunque en
gana el torneo de la Liga Profesional de Fútbol del Norte.
El Regreso al Profesionalismo
En
Junior vuelve a la
después de 13 años de jugar en la Liga de Fútbol del
. En este primer torneo después de 13 años de ausencia, Junior termina 8° con 53 puntos.
Para el año siguiente Junior se armó mejor, contratando jugadores brasileños y destacándose la presencia en el equipo del otrora ídolo del fútbol brasileño:
, que solo jugó un partido, contra
en
, llenándose el estadio solo para verlo jugar a él. Al final del torneo Junior termina quinto con 59 puntos.
En
llega al equipo Jesús "El Toto" Rubio y Junior logra su segundo subcampeonato, por detrás del
, igualándolo en puntos pero perdiendo por diferencia de goles, logrando su primera clasificación a
En esta
queda eliminado en la fase de grupos al quedar último, jugando su primer partido en Copa frente a
con victoria juniorista 2-1.
Comienza la era Char
En
,
, trayendo como gran contratación al goleador brasileño Víctor Ephanor y para el
trae al goleador uruguayo
procedente del
y quien al final del torneo termina como goleador con 35 goles. También trae a los defensas Gabriel Berdugo y Dulio Miranda (quien solo se quedaría ese año), jugadores insignes del equipo. Al siguiente año, el goleador es Víctor Ephanor quien hace 33 goles, uno más que el goleador del
Arístides del Puerto.
En
llega el considerado mejor arquero de Junior en la historia: Juan Carlos Delménico y se marcha el goleador del año anterior Víctor Ephanor junto a Jesús "El Toto" Rubio y vuelve al equipo Dulio Miranda. Al
llega al equipo
y al final se marcha el uruguayo Nelson Silva Pacheco.