Década de 2000
Scorsese junto a Leonardo DiCaprio y Cameron Diaz.
En 2002, Scorsese por fin dirigió uno de sus más ansiados proyectos,
Gangs of New York, la cual fue su empresa más arriesgada hasta el momento, con presupuesto superior a los cien millones de dólares, el más alto en la carrera de Scorsese. La reacción de la crítica hacia la película fue moderadamente positiva, y a pesar de su alto coste consiguió recuperar gastos e incluso produjo beneficios, por lo que la aventura se saldó con éxito. Además, recibió diez nominaciones al
Óscar, incluyendo
Mejor película,
Mejor director, y
Mejor actor (para Daniel Day-Lewis). Scorsese perdió nuevamente, esta vez frente a Roman Polanski y su
El Pianista y frente a
Chicago. Significó el comienzo de su alianza con Leonardo DiCaprio.
El siguiente filme de Scorsese fue
The Aviator (
El aviador), película biográfica del excéntrico multimillonario y pionero de la aviación Howard Hughes. El filme fue lanzado a finales de 2004, con polarización de la crítica. Ganó tres Globos de Oro, incluyendo el de Mejor película dramática. En la entrega de los premios Óscar,
El aviador fue la película con más nominaciones (once, incluyendo Mejor película, Mejor director y Mejor actor para Leonardo DiCaprio). Esta vez, Scorsese también salió con las manos vacías, al ver a Clint Eastwood llevarse el Óscar al mejor director y a la Mejor película con
Million Dollar Baby.
Scorsese es Presidente de Film Foundation, una fundación sin fines de lucro dedicada a la preservación del material fílmico en deterioro.
El 5 de enero de 2005, Scorsese recibió el reconocimiento de la
Légion d'honneur de parte del gobierno de Francia, por sus contribuciones al cine.
Después de presentar su documental sobre Bob Dylan en 2005,
No Direction Home, sorprendió a todos en 2006 con su galardonada película
The Departed (
Los infiltrados), con la cual cosechó numerosos elogios. En esta cinta policíaca se reunió nuevamente con Leonardo DiCaprio y, por primera vez, con Jack Nicholson. El 25 de febrero de 2007, la Academia de Artes y Ciencias Cinematograficas de Hollywood le entregaba el Óscar al mejor director (y otros 3 Óscar, entre ellos el de Mejor película) con lo que se hacía justicia con uno de los más grandes directores de los EE. UU., que había sido nominado 8 veces y nunca había ganado, ni como director ni como guionista.
A finales de 2007 rueda un spot publicitario para la firma de cava Freixenet:
The Key to Reserva, traducido al español como
La clave Reserva, en el que Scorsese ha realizado un cuidado homenaje a Alfred Hitchcock, especialmente a su película
El hombre que sabía demasiado.
En la 67 ceremonia de los Globos de oro se le otorgará el premio Cecil B. DeMille por su gran carrera en la industria cinematográfica.
En 2008 realiza el documental
Shine a Light, sobre el grupo de rock Rolling Stones. Ese mismo año se anuncia su participación como productor de la serie
Boardwalk Empire, ambientada en la época de la Ley seca. Cuenta con Steve Buscemi, Kelly Macdonald, Michael Pitt, Michael Shannon y Stephen Graham como actores, y además el mismo Scorsese dirigió el capítulo piloto. En el año 2010, Scorsese vuelve a juntarse por cuarta vez con Leonardo DiCaprio, en la pelicula de suspenso
Shutter Island, una adaptación de la novela de Dennis Lehane ambientada en la decada del '50, en la que un oficial (DiCaprio) junto con un ayudante (Mark Ruffalo) deben investigar la confusa desaparicion de un interno en un hospital psiquiatrico.
Recientemente, se anunció que el próximo proyecto de Scorsese sera en 3D. Una film llamado
Hugo Cabret, con Jude Law, a estrenarse a fines de 2011.