El abogado Jorge Molano lleva varios de los casos penales más espinosos que tramita actualmente la justicia.
Es el representante de las víctimas de la retoma del Palacio de Justicia en 1985.
representa a las víctimas de la masacre de San José de Apartadó, en la que murieron cinco adultos y tres niños el 21 de febrero de 2005. En la investigación que se está haciendo por esta masacre están vinculados el general Héctor Jaime Fandiño y los coroneles Héctor Iván Duque, José Orlando Acosta y Orlando Espinosa.
Está defendiendo a las víctimas de la Operación Dragón, que supuestamente estaba organizada por militares activos y en retiro para atentar contra el senador Alexander López, otros políticos, defensores de derechos humanos y sindicalistas de la empresa Emcali. En este proceso están involucrados los coroneles Julián Villate Leal y Germán Huertas.
representa a los integrantes del sindicato de Emcali, Sintraemcali; del Sindicato de Trabajadores de la Empresa de Telecomunicaciones de Bogotá, Sintrateléfonos, y del Sindicato de Trabajadores y Empleados Universitarios de Colombia, Sintraunicol. En este caso, la demanda es contra el vicepresidente Francisco Santos por injuria y calumnia. Según dice en el proceso, el funcionario alguna vez calificó a estos sindicatos como auxiliadores del terrorismo.
Otro caso espinoso que lleva Molano es contra el candidato presidencial Germán Vargas Lleras y es también por injuria y calumnia. Gloria Cuartas, actual candidata al Senado, lo denunció. Según Cuartas, en las pasadas elecciones, cuando aspiraba alcanzar una curul en esa misma corporación, Vargas supuestamente llegó a la plaza de Paloquemao y les ordenó a sus escoltas arrancar la publicidad que su equipo de campaña había puesto. El argumento de Vargas, según la denuncia, fue que si el presidente Uribe supiera que en ese lugar había afiches de guerrilleros, se enojaría
y por ultimo tiene los procesos por posibles vínculos con paramilitares de los generales del Ejército Iván Ramírez Quintero, Carlos Alberto Ospina, Rito Alejo del Río y Julio Charry. Según Molano, los cuatro generales fueron señalados por los paramilitares ‘Salvatore Mancuso’ y Ever Veloza, alias ‘H.H’ de haber sido colaboradores de sus ejércitos ilegales en Antioquia y la Costa Caribe.