Mira este pantallazo, yo lo hice asi:

Click derecho sobre el archivo que baje, descomprimi, y me quedo la carpeta con los archivos dentro, la abro, ejecuto el Zsnesw.exe (ventana de la derecha), y me ejecuta inmediatamente el emulador (ventana central con tonos azules y morados), solo le das Load y buscas el Rom (o juego).