Es una versión realizada sobre el Touareg V10 TDI (313 CV); tiene un aspecto diferente y unas modificaciones en el motor para que dé 351 CV, 38 CV más (ficha comparativa).

Los todoterreno Diesel más próximos por potencia (en orden decreciente) son el Audi Q7 4.2 TDI (326 CV), el Volkswagen Touareg 5.0 V10 TDI (313 CV) y los Mercedes-Benz ML y GL con el motor 420 CDI (306 CV). A finales de 2008, Audi tiene previsto comercializar una versión del Q7 con un motor V12 TDI de 500 CV.

El Touareg R50 cuesta 100.230 €, casi 15.000 € más que la versión de la que deriva y más que cualquier otro todoterreno Diesel a la venta en España, si bien es el más potente de todos ellos.

El Touareg R50 acelera de 0 a 100 km/h en 6,7 s, lo que supone una mejora de 0,7 s respecto a la versión de 313 CV. Aún con todo, no es el más rápido entre los de su tipo: el Audi Q7 4.2 TDI y el Mercedes-Benz ML 420 CDI lo son más. El Volkswagen Touareg tiene un peso elevado en todas sus versiones.