Para mi Linux es mejor que Windows y aqui van mis argumentos que son válidos:
Linux es más estable, más seguro, es software libre por el cual no hay que pagar, se puede copiar, modificar y distribuir sin ninguna restricción, es un sistema operativo práctiamente de red y es una de sus fortalezas.
El kernel de Linux si tiene bugs pero son corregidos rápidamente por la comunidad GNU... virus para Linux si los hay: hay uno que otro gusano, rootkit pero con un parchesito listo el problema......
Linux te da más poder sobre el sistema (siempre y cuando tengas los debidos permisos como superusuario) y cada uno de sus componentes.
Por el contrario Windows no lo desmerito, pues lo utilizo diario pero lo maluco es que cada mes sale minimo una actualización para corregir un error, sus licencias son más bien costosistas, un sistema mla configurado puede ser inestable y afectar su rendimiento.
Linux está creciendo y ya se está desarrollando mucho software para este similar e incluso mejor que las versiones para Windows y lo mejor es que la mayoría son gratis!!!!
Bueno esa es mi humilde opinión.....
Salu2