Es que la diferencia es clara, basta con tener claro que es una "Federación" (no confundir con la "confederación" que es otro cuento).

Federación no es mas que una agrupación institucionalizada de entidades sociales o "Estados" relativamente autónomos. Común mente se les conocen como estados o "Repúblicas Federales". Aquí hay un detalle muy importante, sus sistemas políticos, suelen ser "Republicanos" y en algunos casos, como en la antigua Rusia Federada, un sistema monarquico (la era de los Zares).

Para graficar mejor, podemos observar el sistema de EEUU, México o Argentina que son naciones federadas.

La Federación Rusa, nació después de la desintegración de lo que se conoció como URSS. Pero para poder entender un poco mas el porqué estas naciones que fueron parte de la antigua URSS, quieren adherirse a la actual Federación, hay que conocer un poco de la historia de la antigua Rusia, donde se ve claramente como en una basta región, existían muchas tribus que lograron unirse pero con sistemas de gobierno autónomos. Eso, está arraigado en ellos, de allí ese mal entendido de algunos cuando se habla de "que buscan su independencia o autonomía".

Este sistema de "Federación", lo experimentaron desde sus inicios como naciones. Durante el sistema de la URSS, lo que conocemos como "Rusia" (entiendase el país) simplemente fue una especie de Estado Federado capital. Así se designó, simplemente porque era allí donde predominaba o era mas fuerte el sistema de izquierda bolchevique.

Hoy en día, todos sabemos muy bien, que en Rusia no existe dicho sistema de gobierno, independiente de que aún existan los partidos, así como en Chile, por mucho que gobierne un mandatario de izquierda, el sistema de gobierno no lo es.

Espero que en algo tan corto o breve, te pueda haber ayudado a aclarar un poco mas respecto a éste tema. El resto mi amigo, san google lo puede ayudar con mas tiempo y mucho material de apoyo, especialmente de historia para comprender mas lo que para ellos es el sistema de "federación".